Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms