Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSSK4Q6SA08 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms