Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Spock1Q62288 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Spock1Q62288 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Spock1Q62288 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Spock1Q62288 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Spock1Q62288 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Spock1Q62288 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms