Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cog7Q3UM29 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms