Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A5Q15758 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC1A5Q15758 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms