Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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