Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF5Q13568 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF5Q13568 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF5Q13568 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF5Q13568 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF5Q13568 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF5Q13568 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRF5Q13568 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRF5Q13568 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRF5Q13568 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF5Q13568 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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