Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP4F3Q08477 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4F3Q08477 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms