Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms