Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX1P78337 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX1P78337 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX1P78337 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX1P78337 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX1P78337 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX1P78337 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX1P78337 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX1P78337 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX1P78337 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX1P78337 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX1P78337 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX1P78337 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX1P78337 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX1P78337 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX1P78337 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX1P78337 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX1P78337 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX1P78337 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX1P78337 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX1P78337 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX1P78337 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX1P78337 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX1P78337 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX1P78337 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX1P78337 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX1P78337 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX1P78337 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX1P78337 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX1P78337 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX1P78337 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX1P78337 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX1P78337 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX1P78337 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX1P78337 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX1P78337 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX1P78337 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX1P78337 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX1P78337 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX1P78337 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX1P78337 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX1P78337 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX1P78337 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX1P78337 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX1P78337 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX1P78337 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX1P78337 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX1P78337 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX1P78337 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX1P78337 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX1P78337 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX1P78337 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX1P78337 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX1P78337 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX1P78337 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX1P78337 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX1P78337 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX1P78337 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX1P78337 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX1P78337 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX1P78337 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX1P78337 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms