Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNRPNP63162 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms