Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Abce1P61222 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abce1P61222 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abce1P61222 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abce1P61222 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abce1P61222 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms