Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms