Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP1P48552 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms