Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab23P35288 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab23P35288 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab23P35288 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab23P35288 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms