Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A1P19634 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A1P19634 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms