Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCP1P17987 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCP1P17987 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCP1P17987 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCP1P17987 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCP1P17987 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCP1P17987 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCP1P17987 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCP1P17987 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCP1P17987 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCP1P17987 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCP1P17987 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCP1P17987 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCP1P17987 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCP1P17987 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCP1P17987 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCP1P17987 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCP1P17987 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCP1P17987 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCP1P17987 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCP1P17987 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCP1P17987 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCP1P17987 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCP1P17987 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCP1P17987 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCP1P17987 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCP1P17987 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCP1P17987 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCP1P17987 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCP1P17987 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCP1P17987 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCP1P17987 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCP1P17987 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCP1P17987 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCP1P17987 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCP1P17987 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCP1P17987 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCP1P17987 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCP1P17987 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCP1P17987 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCP1P17987 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCP1P17987 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCP1P17987 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCP1P17987 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCP1P17987 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCP1P17987 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCP1P17987 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCP1P17987 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCP1P17987 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCP1P17987 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCP1P17987 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TCP1P17987 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCP1P17987 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCP1P17987 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCP1P17987 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCP1P17987 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCP1P17987 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms