Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms