Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFMP07197 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFMP07197 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFMP07197 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFMP07197 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFMP07197 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFMP07197 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFMP07197 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFMP07197 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFMP07197 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFMP07197 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFMP07197 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFMP07197 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEFMP07197 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFMP07197 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFMP07197 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFMP07197 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFMP07197 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFMP07197 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFMP07197 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFMP07197 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFMP07197 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFMP07197 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFMP07197 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFMP07197 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFMP07197 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFMP07197 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFMP07197 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms