Protein–RNA interactions for Protein: L7N229

Gm4778, Predicted gene 4778, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4778L7N229 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4778L7N229 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms