Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3KR12 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
J3KR12 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
J3KR12 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3KR12 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3KR12 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.27■■□□□ 1
J3KR12 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
J3KR12 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
J3KR12 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
J3KR12 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.27■■□□□ 1
J3KR12 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3KR12 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
J3KR12 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3KR12 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.27■■□□□ 1
J3KR12 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3KR12 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3KR12 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3KR12 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3KR12 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
J3KR12 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3KR12 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3KR12 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3KR12 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3KR12 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3KR12 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3KR12 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3KR12 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3KR12 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3KR12 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3KR12 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3KR12 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3KR12 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3KR12 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3KR12 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3KR12 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3KR12 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
J3KR12 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3KR12 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3KR12 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3KR12 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3KR12 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3KR12 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3KR12 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3KR12 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3KR12 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3KR12 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3KR12 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3KR12 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3KR12 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3KR12 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3KR12 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3KR12 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3KR12 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3KR12 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3KR12 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3KR12 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3KR12 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3KR12 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3KR12 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3KR12 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3KR12 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3KR12 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3KR12 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3KR12 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
J3KR12 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3KR12 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3KR12 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms