Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm17333C6EQI3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm17333C6EQI3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm17333C6EQI3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm17333C6EQI3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm17333C6EQI3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm17333C6EQI3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm17333C6EQI3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm17333C6EQI3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17333C6EQI3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Gm17333C6EQI3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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