Protein–RNA interactions for Protein: B2RW88

Prr19, Proline-rich 19, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr19B2RW88 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Prr19B2RW88 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr19B2RW88 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr19B2RW88 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr19B2RW88 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr19B2RW88 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Prr19B2RW88 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Prr19B2RW88 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Prr19B2RW88 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Prr19B2RW88 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Prr19B2RW88 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Prr19B2RW88 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Prr19B2RW88 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr19B2RW88 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms