Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGK8

SERGEF, Secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEFQ9UGK8 KAT7-202ENST00000424009 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 ADAMTS20-202ENST00000395541 4633 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 TIA1-203ENST00000415783 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 HSD17B2-201ENST00000199936 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 UNC45A-216ENST00000639885 3255 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 ZDHHC11B-202ENST00000508859 1631 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 INPP4A-210ENST00000523221 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 CCND2-201ENST00000261254 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 CCR9-202ENST00000357632 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 ACAA2-201ENST00000285093 3350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 POLH-202ENST00000372236 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 STK16-204ENST00000409638 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 MPP7-202ENST00000375719 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 C20orf173-201ENST00000246199 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 ELOB-201ENST00000262306 582 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 DEFA4-201ENST00000297435 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 CIART-202ENST00000369094 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 MIR711-201ENST00000390201 76 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 CAV2-203ENST00000393480 1179 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 AL137222.1-201ENST00000407765 1162 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 RN7SKP54-201ENST00000410704 269 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 AC021028.1-201ENST00000417559 598 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 SLC8A1-AS1-206ENST00000439606 565 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 AL672032.1-201ENST00000440614 938 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 C20orf173-204ENST00000444723 1059 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 KRTAP19-10P-201ENST00000445258 187 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 AL033384.2-201ENST00000474641 456 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 LINC01480-201ENST00000483481 467 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 LINC01480-202ENST00000487420 749 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 LINC01480-203ENST00000494375 409 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 MARK2P6-201ENST00000494974 897 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 AC105416.1-201ENST00000506991 842 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 AC011632.1-201ENST00000523860 773 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 TRIQK-220ENST00000524037 865 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 AC005828.2-201ENST00000580253 562 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 AC004004.1-201ENST00000603784 250 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 HAR1B-202ENST00000608031 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 AC007603.2-201ENST00000623281 506 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 AC073255.1-201ENST00000624149 177 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L13-201ENST00000429667 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L11-201ENST00000457736 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L30-201ENST00000504104 1593 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L18-201ENST00000504209 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L24-201ENST00000504481 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L28-201ENST00000504543 1593 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L20-201ENST00000506151 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L16P-201ENST00000507155 1593 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L5-201ENST00000507227 1593 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L9P-201ENST00000508843 1593 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L25-201ENST00000509271 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L26-201ENST00000509660 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L22-201ENST00000511280 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L17-201ENST00000511568 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L29-201ENST00000511681 1593 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L19-201ENST00000515566 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 USP17L27-201ENST00000515574 1593 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 AL392083.1-201ENST00000632982 2985 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 AHCYL2-210ENST00000490911 1884 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 KIAA1324-203ENST00000369939 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 RSU1-201ENST00000345264 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 C1orf226-203ENST00000458626 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 C10orf53-202ENST00000374112 2130 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 ZNF544-215ENST00000599953 2274 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 ZNF823-201ENST00000341191 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 TLR12P-201ENST00000413515 2706 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 RAB7B-202ENST00000617991 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 ZWILCH-214ENST00000613446 3181 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 GTF3C2-201ENST00000264720 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 CCDC144NL-AS1-207ENST00000577537 3727 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 MFAP5-201ENST00000359478 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 CHN2-202ENST00000409041 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 HDAC9-210ENST00000428307 2359 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 FAM19A2-201ENST00000416284 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 VNN3-204ENST00000414302 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 UGT1A6-201ENST00000305139 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 ODF2-203ENST00000372807 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 MIR3142HG-201ENST00000517927 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 KCNE1B-202ENST00000618699 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 AC106028.3-201ENST00000562894 1736 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 MBIP-201ENST00000318473 1586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 CENPP-202ENST00000375579 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 LAMA4-205ENST00000389463 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 C17orf102-201ENST00000623254 3997 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 ANKRD7-201ENST00000265224 1298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 PAGE1-201ENST00000376150 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 ZNF343-203ENST00000381253 819 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 KRTAP13-3-201ENST00000390690 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERGEFQ9UGK8 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms