Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP20Q9Y6A4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP20Q9Y6A4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms