Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN2Q9UNF0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PACSIN2Q9UNF0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN2Q9UNF0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN2Q9UNF0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN2Q9UNF0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms