Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIX2Q9NPC8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX2Q9NPC8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms