Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKRIP1Q9H875 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKRIP1Q9H875 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms