Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNMDQ9H2S6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNMDQ9H2S6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms