Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ap1s2Q9DB50 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms