Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms