Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PIK3R4Q99570 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIK3R4Q99570 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PIK3R4Q99570 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PIK3R4Q99570 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms