Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRP36Q96EU6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP36Q96EU6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms