Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac11Q91WA3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac11Q91WA3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms