Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00523Q86TU6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00523Q86TU6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms