Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms