Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcncQ62447 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcncQ62447 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcncQ62447 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CcncQ62447 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcncQ62447 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcncQ62447 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms