Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
USPL1Q5W0Q7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms