Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pitpnm3Q3UHE1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pitpnm3Q3UHE1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms