Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SKOR2Q2VWA4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKOR2Q2VWA4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKOR2Q2VWA4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKOR2Q2VWA4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKOR2Q2VWA4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKOR2Q2VWA4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKOR2Q2VWA4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKOR2Q2VWA4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKOR2Q2VWA4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKOR2Q2VWA4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR2Q2VWA4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms