Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLR1Q15399 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms