Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NrepQ07475 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NrepQ07475 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NrepQ07475 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NrepQ07475 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NrepQ07475 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NrepQ07475 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NrepQ07475 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NrepQ07475 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
NrepQ07475 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NrepQ07475 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NrepQ07475 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NrepQ07475 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NrepQ07475 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NrepQ07475 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NrepQ07475 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms