Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smarcad1Q04692 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms