Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP4Q02446 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP4Q02446 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP4Q02446 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP4Q02446 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP4Q02446 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP4Q02446 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP4Q02446 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP4Q02446 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP4Q02446 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP4Q02446 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP4Q02446 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP4Q02446 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP4Q02446 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SP4Q02446 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP4Q02446 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SP4Q02446 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP4Q02446 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP4Q02446 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP4Q02446 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP4Q02446 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP4Q02446 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP4Q02446 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP4Q02446 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP4Q02446 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SP4Q02446 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP4Q02446 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP4Q02446 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP4Q02446 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP4Q02446 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP4Q02446 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms