Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms