Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHMBP2P38935 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGHMBP2P38935 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms