Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab17P35292 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab17P35292 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab17P35292 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab17P35292 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab17P35292 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab17P35292 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab17P35292 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab17P35292 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms