Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH4A1P30038 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH4A1P30038 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH4A1P30038 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH4A1P30038 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH4A1P30038 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH4A1P30038 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH4A1P30038 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH4A1P30038 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH4A1P30038 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH4A1P30038 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH4A1P30038 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH4A1P30038 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH4A1P30038 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH4A1P30038 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms