Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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P18529 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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P18529 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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P18529 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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P18529 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18529 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18529 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18529 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18529 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18529 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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P18529 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18529 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18529 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18529 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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P18529 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18529 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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P18529 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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P18529 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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P18529 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18529 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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P18529 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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P18529 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18529 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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P18529 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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P18529 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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P18529 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18529 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18529 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18529 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18529 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18529 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18529 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18529 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18529 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18529 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18529 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms