Protein–RNA interactions for Protein: P02831

Hoxa3, Homeobox protein Hox-A3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa3P02831 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa3P02831 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms